Cientistas do Instituto Pirbright geraram um conjunto de genoma quase completo para uma raça consanguínea de porco doméstico, aumentando o uso potencial do animal na medicina de saúde humana e animal e permitindo maior compreensão de doenças virais como a peste suína africana (PSA).

Derivado da raça de porco doméstico Large White, o porco Babraham, altamente consanguíneo, é geneticamente uniforme em importantes complexos de genes relacionados ao sistema imunológico, permitindo maior reprodutibilidade em estudos imunológicos.

Além da montagem do genoma, os pesquisadores desenvolveram um atlas do transcriptoma do porco Babraham – uma coleção de dados que fornece informações sobre padrões de expressão genética em diferentes tecidos dentro de um organismo.

O especialista em bioinformática Dr. John Schwartz disse: “Depois que geramos a montagem do genoma e avaliamos as prováveis ​​fontes de erro, comparamos a uniformidade em todo o genoma com outro porco Babraham. Os dados de transcrição genética foram então usados ​​de vários tecidos para investigar o conteúdo e o uso do gene dentro de vários complexos de genes relacionados ao sistema imunológico.

“Isso nos permitiu caracterizar e anotar com confiança os genes envolvidos nas respostas imunológicas no porco Babraham e compará-los com outros genomas para obter insights sobre sua evolução e impacto na saúde.”

O estudo, publicado na Immunogenetics e financiado pelo UKRI Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) e Wellcome, mostrou que a qualidade e a integridade da montagem do genoma provavelmente foram auxiliadas pela alta quantidade de endogamia presente nos porcos Babraham.

Porcos, como humanos, são diploides, o que significa que eles têm duas cópias ligeiramente diferentes de seu genoma – uma de cada pai. Em indivíduos altamente consanguíneos, essas duas cópias são mais semelhantes. Essa uniformidade genética torna mais fácil juntar as peças porque há menos diferenças a serem consideradas entre as duas cópias.

“Acreditamos que este novo atlas de montagem do genoma e transcriptoma aumentará ainda mais a utilidade do porco Babraham como modelo biomédico”, disse o Dr. Schwarz.

Os pesquisadores esperam que a nova montagem do genoma ajude nas análises comparativas, fornecendo insights futuros sobre doenças virais que infectam porcos, como a PSA e a gripe. As descobertas também podem informar estudos sobre doenças zoonóticas, que passam de animais para humanos, enquanto a uniformidade genética dos porcos Babraham também pode ser utilizada para estudos de xenotransplante.

O estudo envolveu colaboração com cientistas da Universidade de Cardiff e da Universidade de Utah.